Zbiór dokumentacji historycznej powstał w 1970 r. W jego skład wchodzi 3260 obiektów. Wśród nich jest dokumentacja prac restauracyjnych zamku malborskiego w 2. poł. XIX i 1. poł. XX wieku. Zgromadzone są w niej rysunki inwentaryzacyjne i projektowe, zarówno wyglądu zewnętrznego zamku, jego wnętrz, jak też wystroju rzeźbiarskiego, malarskiego oraz wyposażenia. Do tego niezwykle cennego zbioru należy również zestaw albumów fotograficznych (roczniki o nazwie Marienburg Baujahr), w których od 1882 do 1918 r. przedstawiana była na zdjęciach, zaopatrzonych w komentarz, historia prac konserwatorskich oraz najważniejsze wydarzenia z dziejów zamku. Dokumentacja historyczna obejmuje również dokumenty archiwalne powstałe w okresie od XVIII do XX w. takie jak zestaw malborskich dokumentów cechowych, dokumentów parafii żuławskich, a także faksymile aktów prawnych, dotyczących historii Malborka i Prus z okresu krzyżackiego oraz polskiego. W jej skład wchodzi ponad 900 pocztówek, pochodzących z okresu od lat 90. XIX do 70. XX w., których zasięg terytorialny stanowią przede wszystkim dawne prowincje pruskie. Najsilniej reprezentowany jest Malbork oraz inne wielkie miasta regionu: Gdańsk, Królewiec czy Toruń. Osobną część tej kolekcji stanowi 181 zabytków kartograficznych od XVI wieku po lata 40. XX wieku prezentujących głównie dawne tereny Prus, lecz również Polskę w granicach przedrozbiorowych oraz Niemcy.